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20級博士生劉夢雅同學(xué)的工作被《Briefings in Bioinformatics》錄用
來源: 孫戰(zhàn)里/
安徽大學(xué)
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2024-12-08

 

 

RNA N6-methyladenosinem6A)是一種關(guān)鍵的表觀遺傳修飾,與水稻的生長發(fā)育和應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān)。m6A的準確識別是揭示表型調(diào)控和分子機制的基礎(chǔ),直接關(guān)系到精準水稻育種與改良。然而,針對水稻m6A不定長序列,采用最大長度填充的方式會導(dǎo)致信息稀疏和無效填充,降低了特征提取的準確率。因此,針對這一研究方向,20級博士生劉夢雅同學(xué)提出了一種新型的深度學(xué)習(xí)框架MFDm6ARice,通過設(shè)計的多核特征融合模塊和下采樣殘差特征嵌入模塊進行水稻m6A位點預(yù)測。實驗結(jié)果表明,MFDm6ARice在交叉驗證及獨立測試集上優(yōu)于對比方法,具有良好的魯棒性和泛化能力,并在玉米m6A的應(yīng)用中展現(xiàn)了良好的可擴展性。

20241128日,相關(guān)研究工作,"Multi-kernel feature extraction with dynamic fusion and downsampled residual feature embedding for predicting rice RNA N6-methyladenine sites",被《Briefings in Bioinformatics》錄用。該期刊是國際知名的生物信息學(xué)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)性刊物,主要關(guān)注生物信息學(xué)和計算生物學(xué)的研究進展,涵蓋生物信息學(xué)各個方面,包括數(shù)據(jù)分析、算法開發(fā)、人工智能與機器學(xué)習(xí)在生物學(xué)中的應(yīng)用等。2024年期刊影響因子是6.8,中科院SCI期刊分區(qū)中數(shù)學(xué)與計算生物學(xué)方向的一區(qū)期刊,被選為該領(lǐng)域的Top期刊。


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