灣區(qū)時訊 近日,中國科學(xué)院南海海洋研究所熱帶海洋生物資源與生態(tài)重點實驗室(LMB)閆巖研究員團隊在真菌直線型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成與酶反應(yīng)機制研究方面取得新進展,相關(guān)成果“An Enzymatic Carbon-Carbon Bond Cleavage and Aldol Reaction Cascade Converts an Angular Scaffold into the Linear Tetracyclic Core of Ochraceopones”在線發(fā)表于Angewandte Chemie International Edition(《德國應(yīng)用化學(xué)》)。助研李艷芹、碩士叢夢靜為共同第一作者,閆巖、王俊鋒與張長生研究員為共同通訊作者。
混源萜(meroterpenoids)是一類部分分子骨架來源于萜烯的天然產(chǎn)物,它們具有復(fù)雜多樣的化學(xué)結(jié)構(gòu)及廣泛的生物學(xué)活性。這些豐富的骨架結(jié)構(gòu)既可能來源于萜烯部分多樣化的重排與環(huán)化,也可能來源于其非萜烯部分如聚酮、吲哚、莽草酸等豐富的后修飾。因此其生物合成途徑中可能蘊含了大量新穎的酶促化學(xué)反應(yīng)機制,深入研究這些酶學(xué)機制將為我們創(chuàng)建具有新型骨架結(jié)構(gòu)和生物學(xué)活性的藥物先導(dǎo)提供基礎(chǔ)。真菌直線型四環(huán)混源萜ochraceopones具有優(yōu)異的抗病毒和抗炎活性,然而其由常見的四元折線型結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化為獨特的直線型結(jié)構(gòu)所涉及的化學(xué)合成和酶學(xué)反應(yīng)機制卻極具挑戰(zhàn)性。
研究團隊早期從一株南極土壤來源真菌Aspergillus ochraceopetaliformis SCSIO 05702中分離得到了一類四環(huán)混源萜類化合物ochraceopones(化合物1-4,7)(J Nat Prod, 2016,79:59-65)?;诨蚪M學(xué)及生物信息學(xué)分析定位了負(fù)責(zé)該類化合物生物合成的基因簇(圖1),通過構(gòu)建構(gòu)巢曲霉異源表達體系,聯(lián)合體外微粒體實驗及蛋白表達,成功鑒定和表征了負(fù)責(zé)化合物ochraceopones形成的所有生物合成酶,并闡明了完整的生物合成途徑(圖2)。
圖1. 直線型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成基因簇
圖2. 直線型四環(huán)混源萜ochraceopones的生物合成途徑推測
在這項研究中,研究團隊證明了ochraceopones的線性四環(huán)骨架是由同一個折線型前體即ochraceopone E(7)衍生而來。通過體外氘水標(biāo)記的微粒體實驗,證實了化合物7生成16涉及的碳-碳鍵斷裂反應(yīng)不是自發(fā)進行的,而是由多功能細(xì)胞色素P450-OchH催化完成。其通過將C13位羥基形成氧自由后促發(fā)C13-C14鍵斷裂,而后通過羥基化形成十元環(huán)的中間體18,之后自發(fā)形成化合物16(圖3)。
圖3. OchH的功能表征
為了驗證16作為真實底物的正確性,研究團隊將16與基因簇內(nèi)其余后修飾基因在構(gòu)巢曲霉中進行了生物轉(zhuǎn)化,并通過體外微粒體與蛋白的聯(lián)合反應(yīng)證實了該反應(yīng)過程。結(jié)果顯示,異構(gòu)酶OchL通過催化分子內(nèi)的羥醛反應(yīng)將經(jīng)過多步修飾的碳-碳鍵斷裂形成的十元環(huán)重新連接,形成了一個新的碳-碳鍵而呈現(xiàn)出最終的線性四環(huán)化合物3(圖4)。
圖4. 三環(huán)到線性四環(huán)骨架ochraceopones的生物轉(zhuǎn)化表征
然而,在異源表達及體外反應(yīng)過程中,除了獲得一系列不能被繼續(xù)轉(zhuǎn)化的途徑副產(chǎn)物如化合物19、19’、21和23之外,均沒有檢測到反應(yīng)的真正中間體(圖4)。但是就觀察到的實驗結(jié)果表明在目前的生物反應(yīng)體系中,隨著氧化后修飾的多步積累,反應(yīng)的真實底物在缺乏其后續(xù)生物轉(zhuǎn)化酶的條件下無法穩(wěn)定存在??隙ǖ氖?,根據(jù)分離到的一系列副產(chǎn)物及對其形成機制的推測,可以確定整個反應(yīng)中間過程存在的真實性。
總之,本研究鑒定并表征了合成ochraceopones的所有生物合成酶,并證明了完整的生物合成途徑。證實了ochraceopones類化合物是由OchHJGL催化的酶級聯(lián)反應(yīng)將常見的角四環(huán)前體合成獨特線性四環(huán)骨架結(jié)構(gòu)。其中,多功能細(xì)胞色素P450-OchH負(fù)責(zé)催化自由基形成并引發(fā)C-C鍵斷裂和隨后的C12的羥基化,然后OchJ催化C15羥基化和OchG催化C15-OH脫氫。最后,醛縮酶OchL通過催化分子內(nèi)羥醛反應(yīng)導(dǎo)致新的C-C鍵形成而構(gòu)建最終的線性四環(huán)骨架。OchH和OchL的發(fā)現(xiàn)及其功能闡明將為尋找更多新的P450酶和醛縮酶提供途徑。然而,由于OchL底物的不穩(wěn)定性,可能需要通過合成更穩(wěn)定的底物衍生物來進一步研究其催化機理。
上述研究工作得到了國家重點研發(fā)計劃、海南省科技計劃三亞崖州灣科技城科技創(chuàng)新聯(lián)合項目、國家自然科學(xué)基金、中國科學(xué)院王寬誠率先人才計劃“盧嘉錫國際團隊項目”和海南省自然科學(xué)基金等的資助。
相關(guān)論文信息:Yanqin Li#, Mengjing Cong#, Wengui Liu, Xiufeng Zhang, Yiguang Zhu, Yongxaing Song, Wenjun Zhang, Hua Xiao, Yonghong Liu, Changsheng Zhang*, Junfeng Wang*, Yan Yan*. An Enzymatic Carbon-Carbon Bond Cleavage and Aldol Reaction
Cascade Converts an Angular Scaffold into the Linear Tetracyclic Core of Ochraceopones. Angew Chem Int Edit,2024. doi.org/10.1002/anie.202403365
文章鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202403365
通訊員/謝文燕 王沐眾 徐曉璐
責(zé)任編輯/劉秀
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